У Сектору за здравствено осигурање и финансирање у здравству обављају се послови који обухватају: израду нацрта закона и других прописа којима се уређује област обавезног и добровољног здравственог осигурања и здравствене заштите која се пружа грађанима; прописа којима се уређује област лекова, медицинских средстава, опојних дрога и прекурсора и фармацеутских сировина; прописа којима се уређују цене лекова; финансирање здравственог система; израда програма и пројеката који се финансирају из средстава буџета за инвестиције у здравству, као и из средстава Националног инвестиционог плана (у даљем тексту: НИП); праћење, контрола и оцењивање извршења програма и пројеката који се финансирају из средстава буџета за инвестиције у здравству, као и из средстава НИП-а; послови јавних набавки; израду номенклатуре здравствених услуга, као и стручних основа за сачињавање листи чекања; праћење и анализа спровођења обавезног здравственог осигурања, као и добровољног здравственог осигурања; утврђивање есенцијалне листе лекова; израда предлога, праћење и анализа спровођења националне политике у области лекова и медицинских средстава; примена ЕУ стандарда у циљу приступања чланству Европској мрежи Конвенције Фармацеутске инспекције (PIC/S); решавање у управним стварима у првом и другом степену у опојних дрога и прекурсора; утврђивање критеријума за формирање цена лекова и утврђивање предлога цена лекова које усваја Влада; анализа и праћење показатеља здравственог рачуна; анализа и праћење финансирања здравствених технологија; израда програма и пројеката здравствене заштите у ванредним приликама у сарадњи са надлежним органима; анализа снабдевености здравствених установа лековима и предлагање мера за адекватну обезбеђеност лековима здравствених установа из Плана мреже; учешће у изради предлога буџета и финансијског плана; учешће у припреми и вођењу преговора за закључивање и спровођење међународних споразума о обавезном социјалном осигурању; учешће у преговорима о платама запослених у здравственим установама, закључивању колективних уговора у области здравства, сарадња са синдикатима запослених у здравству; учешће у изради прописа којима се уређују допринос за обавезно социјално осигурање; учешће у изради подзаконских аката из надлежности Републичког завода за здравствено осигурање (у даљем тексту: Републички завод); учествовање у припреми и спровођењу међународних споразума и пројеката као и спровођење међународне сарадње у области лекова и медицинских средства, опојних дрока и прекурсора; праћење и анализа финансирања здравствене заштите из средстава Републичког завода; праћење и анализа система здравственог осигурања у земљама Европске Уније; сарадња са другим државним органима и организацијама, здравственим установама, факултетима здравствене струке, Агенцијом за лекове и медицинска средства Србије (у даљем тексту: Агенција),  као и са правним лицима у области лекова, медицинских средстава, опојних дрога, прекурсора и фармацеутских сировина и друге послове из делокруга Сектора.

У Сектору за здравствено осигурање и финансирање у здравству образују се следеће уже унутрашње јединице:

2.1. У Одељењу за здравствено осигурање обављају се послови из области здравственог осигурања, који обухватају: израду нацрта закона и других прописа којима се уређује област обавезног и добровољног здравственог осигурања, као и здравствене заштите која се пружа грађанима; учествовање у припреми и преговорима за закључивање и спровођењу међународних споразума о обавезном социјалном осигурању; анализа и праћење показатеља здравственог рачуна; израда номенклатуре здравствених услуга као и стручних основа за сачињавање листи чекања; израда програма и пројеката здравствене заштите у ванредним приликама у сарадњи са надлежним органима; учешће у изради прописа којима се уређују доприноси за обавезно социјално осигурање; учешће у преговорима о платама запослених у здравственим установама, закључивању колективних уговора у области здравства, сарадња са синдикатима запослених у здравству; праћење и анализа финансирања здравствене заштите из средстава Републичког завода, као и предлагање мера за успостављање економски одрживог система обавезног здравственог осигурања; праћење и анализа спровођења обавезног и добровољног здравственог осигурања; учешће у изради подзаконских аката из надлежности Републичког завода; праћење и анализа извештаја о финансијском пословању (завршни рачун) здравствених установа из Плана мреже; надзор над законитошћу рада и над законитошћу аката Републичког завода; израда базе података из надлежности Одељења; сарадња са другим државним органима и организацијама, здравственим установама, факултетима здравствене струке, као и са правним лицима која врше производњу и промет лекова; и друге послове из делокруга Одељења.

2.2. У Одсеку за лекове и медицинска средства обављају се послови који обухватају: израду нацрта закона и других прописа којима се уређује област лекова, медицинских средстава и фармацеутских сировина; израду есенцијалне листе лекова; учествовање у припреми и спровођењу међународних споразума и пројеката и спровођење међународне сарадње у области лекова и медицинских средстава; израда предлога, праћење и анализа спровођења националне политике у области лекова и медицинских средстава; примена ЕУ стандарда у циљу приступања чланству Европској мрежи Конвенције Фармацеутске инспекције (PIC/S); утврђивање критеријума за формирање цена лекова и утврђивање предлога цена лекова које усваја Влада;  праћење и анализa остваривања права на лекове у оквиру обавезног здравственог осигурања, као и утицај цена лекова на континуирано и доступно остваривање права на лекове који се финансирају из средстава обавезног здравственог осигурања; праћење и анализа цена лекова у земљама у окружењу, као и земљама Европске Уније; анализу снабдевености здравствених установа лековима и предлагање мера за адекватну обезбеђеност здравствених установа из Плана мреже потребним лековима; праћење и анализа утицаја цена лекова на трошкове здравствене заштите, односно на издвајање у финансијском плану Републичког завода за здравствено осигурање; праћење и анализа финансијског плана и финансијског извештаја Агенције, као и Републичког завода за здравствено осигурање; давање сагласности на акт о унутрашњој организацији и систематизацији радних места у Агенцији, као и давање мишљења на износ надокнада за обављање послова из надлежности Агенција; израда базе података из делокруга Одсека; сарадња са другим државним органима и организација, здравственим установама, факултетима здравствене струке, Агенцијом, као и са правним лицима у области лекова, медицинских средстава; и друге послове из делокруга Одсека.

2.3. У Групи за инвестиције у здравству обављају се послови који обухватају: израду нацрта закона и других прописа којима се уређују инвестиције у здравству које се финансирају из средстава буџета као и из средстава НИП-а; учествовање у изради предлога буџета и финансијског плана у делу који се односи на инвестиције у здравству; планирање, прикупљање, обрада, израда, праћење, контрола и оцењивање програма и пројеката инвестиција у здравству који ће се финансирати из средстава буџета, као и из средстава НИП-а; израда критеријума и мерила за утврђивање приоритетних програма и пројеката за инвестиције у здравству који ће се финансирати из средстава буџета, као и из средстава НИП-а; утврђивање расхода за приоритетне програме и пројекте инвестиција у здравству који ће се финансирати из средстава буџета, као и из средстава НИП-а; утврђивање показатеља (индикатора) за евалуацију социјално-медицинских, правних и финансијских ефеката у спровођењу програма и пројеката инвестиција у здравству; прикупљање и консолидација свих релевантних података којима се исказују реалне потребе за финансирање инвестиција у здравству из средстава буџета, као и из средстава НИП-а; израда финансијских докумената који се достављају Министарству финансија на сагласност ради извршења програма и пројеката инвестиција у здравству; послови јавних набавки; израда базе података из надлежности Групе; сарадња са другим државним органима и организацијама, здравственим установама и факултетима здравствене струке и друге послове из делокруга Групе.

2.4. У Одељењу за опојне дроге и прекурсоре обављају се послови који обухватају: учешће у изради нацрта закона, других прописа и аката којима се уређује област опојних дрога и прекурсора и усклађивање прописа са прописима Европске уније у овој области; спровођење и испуњавање обавеза из ратификованих међународних Конвенција УН: Јединствене конвенције о опојним дрогама из 1961., Конвенције о психотропним супстанцама из 1974. и Конвенције Уједињених нација против незаконитог промета опојних дрога и психотропних супстанци из 1988.; припремање документације и предлога Спискова опојних дрога, прекурсора и супстанци ван списка прекурсора у складу са конвенцијама УН које уређују ову област, као и према предлозима надлежних органа Републике Србије; обављање административно-техничких послова за организовање рада и припремање документације за Комисију за превенцију и сузбијање злоупотребе дрога и Комисију за прекурсоре; учешће у изради и спровођењу Стратегије за борбу против дрога у делу контроле опојних дрога и прекурсора; учешће у изради и анализи Акционог плана за превенцију злоупотребе опојних дрога и прекурсора из делокруга Одсека; праћење ефеката примењених међународних и домаћих  пројеката у области опојних дрога и прекурсора; инспекцијске послове и са њима повезане стручне послове у области производње и промета опојних дрога и прекурсора као и решавање у управним стварима у првом степену; издавање дозвола за производњу, односно промет опојних дрога и прекурсора; спровођење поступка претходног обавештења и поступка добијања сагласности на основу претходног обавештења за извоз, односно увоз опојних дрога и прекурсора; припрема документације и издавање дозвола за извоз, увоз и транзит опојних дрога, прекурсора, супстанци ван списка прекурсора и фармацеутских сировина које се могу злоупотребити у области опојних дрога и прекурсора; вођење базе података о субјектима производње, промета, извоза, увоза и транзита у области опојних дрога и прекурсора; праћење и анализирање снабдевености тржишта опојним дрогама и прекурсорима, као и припремање тромесечних и годишњих извештаја за Међународни биро за контролу наркотика (INCB); утврђивање поступка складиштења одузетих опојних дрога, односно прекурсора које су употребљене у недозвољене сврхе и утврђивање даљег поступања са њима; предлагање Министру доношење водича добре праксе за област опојних дрога и прекурсора; утврђивање стандардних оперативних процедура у складу са законом; спровођење активности на информисању јавности о штетном утицају опојних дрога и прекурсора на здравље људи, мерама за смањење ризика и безбедном коришћењу опојних дрога; праћење научних достигнућа и предлагање Министру мера за унапређење стања у области опојних дрога и прекурсора; подношење Министру годишњих извештаја о раду и стању у области опојних дрога и прекурсора; сарадња са здравственим установама и контрола потрошње опојних дрога и прекурсора ради заштите становништва од злоупотребе опојних дрога и прекурсора; сарадња са референтним установама, анализирање и праћење последица употребе, односно злоупотребе опојних дрога и прекурсора на националном нивоу; сарадња са другим органима и организацијама државне управе надлежним у области опојних дрога и прекурсора; испуњавање обавеза према органима других земаља надлежних за област опојних дрога и прекурсора; остваривање сарадње са органима Европске уније у овој области, као и Европским центром за праћење дрога и зависности од дрога (EMCDDA); остваривање сарадње са агенцијама, односно управама других земаља и другим међународним организацијама, као што је Међународни биро за контролу наркотика (INCB), које се баве разним аспектима у области опојних дрога, односно прекурсора; вршење надзора над спровођењем овог закона и друге послове из делокруга Одсека.