У Сектор за инспекцијске послове обављају се послови унутрашњег надзора над имаоцима јавних овлашћења у обављању поверених послова државне управе у области вођења управног поступка и израђује записнике са предлогом мера из области санитарне инспекције, разрађује правила поступка у вршењу инспекцијских послова о увођењу нових метода рада кроз публиковање брошура уз израду посебних програма за стручно усавршавање инспектора и врши њихову едукацију из области вођења управног поступка; израђује записнике о извршеном надзору над радом инспектора у Сектору, периодично и годишње и по утврђеном стању предлаже министру предузимање одговарајућих мера, израђује нацрте решења у другостепеном управном поступку и припрема одговоре на тужбе и одговоре на тужбе у вези са вођењем управног спора и одговоре на тужбе због накнаде штете у вези са вођењем управног поступка инспектора, учествује у изради стратегија, програма и планова Сектора, израђује анализе о раду инспектора у области вођења управног поступка, и друге послове из делокруга Сектора.

У Сектору за инспекцијске послове образују се следеће уже унутрашње јединице:
3.1. Одељење за санитарну инспекцију;
3.2.  Група за послове унутрашњег надзора над имаоцима јавних овлашћења поверених послова у области санитарног надзора;
3.3. Одељење за здравствену инспекцију и здравствени надзор и
3.4. Одсек за инспекцију за лекове и медицинска средства,

3.1. У Одељењу за санитарну инспекцију обављају се инспекцијски и са њима повезани стручни послови који обухватају: санитарни  и здравствени надзор у области заштите становништва од заразних и незаразних болести, безбедности хране, здравствене исправности предмета опште употребе у производњи и промету, јавног снабдевања становништва  хигијенски исправном водом за пиће; контролу санитарно-хигијенског стања објеката под санитарним надзором и средстава јавног саобраћаја; санитарни надзор над лицима која су законом стављена под здравствени надзор, као и надзор над постројењима, уређајима и опремом која се користи ради обављања делатности под санитарним надзором; утврђивање санитарно-хигијенских и здравствених услова објеката под санитарним надзором у поступцима изградње или реконструкције и редовну контролу над тим објектима; санитарни надзор на државној граници; решавање у управним стварима у првом и другом степену; унутрашњи надзор над имаоцима јавних овлашћења у вођењу поверених послова државне управе; надзор над радом санитарних инспектора унутар Одељења; као и друге послове одређене законом из делокруга Сектора.

У Одељењу за санитарну инспекцију образују се следеће уже унутрашње јединице:

3.1.1. Одсек за санитарни надзор Шабац за окружну подручну јединицу Мачванског управног округа, са седиштем у Шапцу;
3.1.2.Одсек за санитарни надзор Пожаревац за подручну јединицу ширу од подручја управног округа за Браничевски и Борски управни округ, са седиштем у Пожаревцу;
3.1.3.Одсек за санитарни надзор Крагујевац за подручну јединицу ширу од подручја управног округа за Шумадијски и Моравички управни округ, са седиштем у Крагујевцу;
3.1.4. Одсек за санитарни надзор Ужице за окружну подручну јединицу Златиборског управног округа, са седиштем у Ужицу;
3.1.5.Одсек за санитарни надзор Краљево за окружну подручну јединицу Рашког управног округа, са седиштем у Краљеву;
3.1.6.Одсек за санитарни надзор Крушевац за окружну подручну јединицу Расинског управног округа, са седиштем у Крушевцу;
3.1.7.Одсек за санитарни надзор Ниш за подручну јединицу ширу од подручја управног округа за Нишавски, Топлички и Зајечарски управни округ, са седиштем у  Нишу;
3.1.8. Одсек за санитарни надзор Врање за окружну подручну јединицу Пчињског управног округа, са седиштем у Врању;
3.1.9.Одсек за санитарни надзор Смедерево за подручну јединицу ширу од подручја управног округа за Подунавски и Поморавски управни округ, са седиштем у Смедереву;
3.1.10.Одсек за санитарни надзор Ваљево за окружну подручну јединицу Колубарског управног округа, са седиштем у Ваљеву;
3.1.11.Одсек за санитарни надзор Лесковац за окружну подручну јединицу Јабланичког управног округа, са седиштем у Лесковцу;
3.1.12.Одсек за санитарни надзор Пирот за окружну подручну јединицу Пиротског управног округа, са седиштем у Пироту;
3.1.13.Одсек за санитарни надзор Приштина за подручну јединицу ширу од подручја управног округа за Косовски и Косовско -Митровачки управни округ, са седиштем у Приштини;
3.1.14.Одсек за санитарни надзор Београд за подручну јединицу за Град Београд, са седиштем у Београду,
3.1.15.Одсек за санитарни надзор за гранично подручје Београд за подручну јединицу за Град Београд (Сурчин, Аеродром, Сајам, Железничка станица, Слободна царинска зона, Макиш, Терминал и Лука) и општине Младеновац, Панчево, Вршац (Ватин), Ковин, Смедерево, Велико Градиште, Пожаревац, Аранђеловац, Ваљево, Смедеревска Паланка, Град Крагујевац, Чачак, Краљево и Јагодина, са седиштем Београду.
3.1.16.Одсек за санитарни надзор за гранично подручје Шабац за подручну јединицу за општине Шабац, Мали Зворник, Љубовија, Лозница (Трбушница), Богатић (Бадовинци), Сремска Митровица (Сремска Рача), Шид (Батровци), Ужице, Бајина Башта, Пожега, Пријепоље, Прибој (Котроман и Увац), са седиштем у Шапцу;
3.1.17.Одсек за санитарни надзор за гранично подручје Суботица за подручну јединицу за Град Нови Сад (Терминал и Лука) и општине Бачка Паланка, Сомбор (Богојево и Бездан), Суботица (Железничка станица, Јавна складишта, Келебија и Хоргош), Кањижа, Сента (Ђала), Кикинда, Зрењанин (Српска Црња и Међа), Сечањ (Јаша Томић), са седиштем у Суботици.
3.1.18.Одсек за санитарни надзор за гранично подручје Димитровград и Прешево за подручну јединицу, за Град Ниш (Терминал и Аеродром) и општине Димитровград (Железничка станица и Градина), Пирот, Зајечар (Вршка Чука), Бор, Мајданпек (Мокрање, Прахово, Текија, Караташ и Кусјак), Лесковац, Крушевац, Трстеник, Босилеград (Рибарци), Бујановац (Прохор Пчињски и Кончуљ), Сурдулица (Стрезимировци), Врање (Ристовац), Лесковац, Прешево, Приштина (Аеродром, Глобочица, Ђенерал Јанковић, Врбница и Ђафа Прушит), са седиштем у Димитровграду.

3.1.1-3.1.14. У одсецима за санитарни надзор обављају се послови који обухватају: санитарни и здравствени надзор у областима под санитарним надзором - непосредним увидом у поступања предузећа, установа и других правних и физичких лица у погледу примене закона и других прописа и аката, са изрицањем управних мера и предузимањем других мера у складу са законом; давање мишљења на планска документа, давање мишљења о санитарним условима у поступку издавања акта о урбанистичко-техничким условима у поступцима изградње објеката под санитарним надзором, решавање у управним стварима у првом степену  и друге послове из делокруга одсека.

3.1.15-3.1.18. У Одсецима за санитарни надзор за гранична подручја обављају се послови који обухватају: инспекцијски надзор у областима под санитарним надзором на граници, односно на другим местима где се врши царињење, контролу здравствене исправности животних намирница и предмета опште употребе који се увозе, контролу путника и превозних средстава у међународном саобраћају, ради спречавања уношења и ширења заразних болести и надзор над спровођењем прописаних мера у области заштите становништва од заразних болести; решавање у управним стварима у првом степену и друге послове из делокруга одсека.

3.2. У Групи за послове унутрашњег надзора над имаоцима јавних овлашћења поверених послова у области санитарног надзора, врше се послови унутрашњег надзора над имаоцима јавних овлашћења у вођењу поверених послова државне управе у областима под санитарним надзором, израђују се записници са предлогом мера; израђују се записници о извршеном надзору над радом санитарних инспектора у Одељењу из области под санитарним надзором, периодично и годишње и по утврђеном стању предлаже се министру предузимање одговарајућих мера, израђује се стручно мишљење за израду нацрта другостепеног решења из области под санитарним надзором, учествује се у припреми стручних основа за израду нацрта закона и других прописа у области под санитарним надзором; обављају се и друге послове из делокруга Групе.

3.3. У Одељењу за здравствену инспекцију и здравствени надзор обављају се инспекцијски и са њима повезани стручни послови који обухватају: инспекцијски здравствени надзор у вези са радом здравствених установа, приватне праксе и других правних лица која обављају здравствену делатност; надзор над законитошћу рада и надзор над законитошћу аката; проверу квалитета стручног рада здравствене службе; решавање у управним стварима у првостепеном управном поступку, изрицање управних мера и подношење пријава надлежним правосудним органима; оснивање и престанак рада здравствених установа и приватне праксе; доношење решења о привременом престанку рада по захтеву приватне праксе; евидентирање и ажурирање базе података из делокруга Одељења; процену организовања, спровођења спољне провере квалитета стручног рада; контролу извршења наложених мера, праћење квалитета здравствене заштите анализом извештаја о спољној и унутрашњој провери квалитета стручног рада; сарадња са другим државним органима и институцијама и друге послове из делокруга Одељења.

У Одељењу за здравствену инспекцију и здравствени надзор, образују се следеће уже унутрашње јединице:

3.3.1. Одсек за здравствену инспекцију Београд за подручну јединицу за Град Београд, са седиштем у Београду;
3.3.2. Одсек за здравствену инспекцију Нови Сад за подручну јединицу ширу од подручја управног округа за Севернобачки, Средњебанатски, Севернобанатски, Јужнобанатски, Западнобачки, Јужнобачки и Сремски управни округ, са седиштем у Новом Саду;
3.3.3. Одсек за здравствену инспекцију Ниш за подручну јединицу ширу од подручја управног округа за Нишавски, Борски, Зајечарски, Топлички, Пиротски, Јабланички и Пчињски управни округ, са седиштем у Нишу;
3.3.4. Одсек за здравствену инспекцију Крагујевац за подручну јединицу ширу од подручја управног округа за Шумадијски, Рашки, Расински, Косовско-митровачки, Косовски, Призренски, Пећки и Косовско-поморавски управни округ, Поморавски, Браничевски и Подунавски управни округ са седиштем у Крагујевцу;
3.3.5. Одсек за здравствену инспекцију Ужице за подручну јединицу ширу од подручја управног округа за Златиборски, Мачвански, Колубарски и Моравички управни округ, са седиштем у Ужицу;

3.3.1. до 3.3.5. У одсецима за здравствену инспекцију обављају се послови који обухватају: надзор над законитошћу рада и надзор над законитошћу аката; решавање у управним стварима у првостепеном управном поступку, изрицање управних мера и подношење пријава надлежним правосудним органима; инспекцијски надзор непосредним увидом у пословање, документацију и поступање здравствених радника, здравствених  сарадника и физичких лица  у здравственим установама и приватној пракси и другим правним лицима која обављају здравствену делатност, на основу које се остварује здравствена заштита грађана; оснивање и престанак рада здравствених установа и приватне праксе; непосредан увид у спровођење мера наложених у поступку провере квалитета стручног рада у здравственој установи, односно приватној пракси и друге послове из делокруга одсека.

3.4. У Одсеку за инспекцију за лекове и медицинска средства обављају се послови који обухватају: учествовање у припреми и спровођењу међународних споразума и пројеката као и спровођење међународне сарадње у области лекова, медицинских средстава; израду елабората, анализа, студија и програма у области производње и промета лекова и медицинских средстава; припрема упутстава за рад инспектора за лекове и медицинска средства, инспекцијске послове и са њима повезане стручне послове у области производње, израде галенских лекова, промета и испитивања лекова, фармаковигиланце, односно вигиланце медицинских средстава; издавање дозвола за производњу лекова и медицинских средстава, дозвола за промет лекова и медицинских средстава на велико, дозвола за промет медицинских средстава на мало, дозвола за израду галенских лекова; процену и анализу дефекта квалитета лекова и фалсификованих лекова и медицинских средстава; вођење Регистара о субјектима производње, промета и испитивања у области лекова и медицинских средстава и галенским лабораторијама, Регистра издатих  сертификата о примени Смерница добре произвођачке праксе, евиденцију издатих решења о укидању решења о издавању сертификата о примени смерница Добре произвођачке праксе, вођење Регистра  лабораторија, Регистра  издатих  сертификата о примени Смерница добре лабораторијске праксе, евиденције издатих решења о укидању сертификата Добре лабораторијске праксе; примена ЕУ стандарда у циљу приступања чланству Европској мрежи Конвенције Фармацеутске инспекције (PIC/S); послове везане за примену смерница Добре произвођачке праксе, Добре дистрибутивне праксе и Добре лабораторијске праксе; решавање у управним стварима у првом степену у области лекова, медицинских средстава; сарадња са Агенцијом за лекове и медицинска средства и са другим државним органима, организацијама, институцијама и удружењима у области лекова, медицинских средстава, и друге послове из делокруга Одсека.